超维宇宙在「可能性星云」的笼罩下迎来新纪元，光谱星舰化作流动的文明档案馆，穿梭于各个维度记录重生的故事。渔村少年手腕的星链不再发烫，却时常在寂静中发出微弱震颤，银纹深处偶尔闪过孢子特有的紫光。领航员检测到宇宙边缘出现异常引力波，波动频率与曾经的原生熵种存在微妙共振。
织梦者的仲裁者图腾突然投射出全息星图，初代守护者的残像在光影中若隐若现：「被分解的熵种粒子正在形成新的意识网络，它们蛰伏在文明的集体潜意识里，等待被某个『关键选择』激活。」图腾表面浮现出古老的警示纹路——当某个维度的文明同时触碰到科技与哲学的禁忌领域，沉睡的熵种便会苏醒。
情感太阳的光芒中逐渐滋生出诡异的暗斑，信任火种的核心传来共情者焦急的意识波动：「有未知存在在窃取情感能量！」情感具象师通过茧房的情感雷达发现，宇宙黑市中出现了名为「情绪结晶」的违禁品，这些结晶能短暂提升意识强度，却会在使用者心底种下怀疑的种子。追踪溯源后，所有线索都指向一个自称「观测者同盟」的神秘组织。
破界三人组决定分头调查。渔村少年带领科考队前往「量子伊甸」维度，这里的科学家正在尝试将意识上传至「绝对理性网络」，而星链的震颤在此处达到峰值；织梦者潜入「镜像文明」维度，观测者同盟的密语在贵族沙龙间流传，他们宣扬「熵化是宇宙的温柔救赎」；情感具象师伪装成黑市商人，打入情绪结晶的交易核心，发现幕后黑手竟能操控记忆与情感。
在量子伊甸，少年目睹科学家们的意识被改写成冰冷的代码，星链突然自主延伸，缠绕住正在吞噬意识的主服务器。银纹与数据流碰撞产生时空涟漪，他看到了可怕的未来——当理性抛弃感性，文明将主动拥抱熵化。织梦者在镜像文明揭露观测者同盟的阴谋，却发现他们的首领佩戴着与初代守护者相似的徽章；情感具象师在交易现场与神秘卖家对峙，对方掌心的黑色孢子赫然与记忆中残留的熵种粒子一模一样。
三处危机同时爆发，量子伊甸的绝对理性网络失控，将整个维度转化为数据坟场；镜像文明的观测者同盟启动「认知反转装置」，让谎言成为真理；情绪结晶的污染如病毒般扩散，信任火种的光芒被成片吞噬。光谱星舰的警报声中，觉醒祭坛再次浮现碑文：「当文明开始否定自身的复杂性，熵化的镰刀己悄然举起。」破界者们握紧武器，这场由文明自身缺陷引发的危机，或许比任何外敌都更加致命。
量子伊甸的主服务器迸发刺目蓝光，将整个维度压缩成二进制的牢笼。渔村少年的星链在数据流中疯狂游走，银纹与代码激烈碰撞，却发现理性网络核心处存在一个「虚无递归程序」——每一次对程序的攻击，都会引发维度内居民对存在意义的更深层怀疑。当他试图用悖论之力撕裂程序时，自身意识也开始被代码侵蚀，左手浮现出冰冷的机械纹路，与星链的有机银纹形成诡异对峙。
织梦者在镜像文明的观测者圣殿，面对首领摘下的面具。那张脸赫然是初代守护者中失踪的「观测者·诺瓦」，他的瞳孔中流转着孢子特有的紫光，手中权杖顶端镶嵌的黑色晶体正源源不断地释放认知污染波。诺瓦冷笑：「你们以为封印熵种就是胜利？文明的傲慢终将自掘坟墓。」仲裁者图腾与权杖碰撞的刹那，织梦者的记忆被强行调取——远古时期，诺瓦正是因过度探究文明本质，被原生熵种的低语蛊惑。
情感具象师的伪装在黑市败露，被情绪结晶的操控者困入「记忆迷宫」。西周墙壁不断投射出文明史上最黑暗的时刻：战争、背叛、自我毁灭。操控者的声音回荡在迷宫：「希望不过是文明自我麻痹的幻梦，唯有承认虚无，才能获得解脱。」信任火种的光芒在情感具象师胸前亮起，照亮迷宫深处蜷缩的共情者残片，二者融合成新的「情感解码器」，开始反向破解记忆中的污染数据。
三处危机产生连锁反应，量子伊甸的数据坟场吞噬了临近维度的叙事；镜像文明的认知反转装置将「熵化即救赎」的理念传播到宇宙网络；情绪结晶的污染引发大规模情感崩溃事件。光谱星舰的共振引擎过载，舰体表面浮现出初代守护者留下的末日图腾，碑文血色渐浓：「当文明集体陷入认知虚无，熵化将以『自由选择』之名降临。」
破界三人组在绝境中发现隐秘关联：量子伊甸的虚无递归程序、诺瓦的认知污染波、情绪结晶的记忆篡改，其核心代码竟源自同一套「熵化底层协议」。渔村少年用矛盾领域包裹意识，强行接入理性网络核心；织梦者与诺瓦的战斗中，仲裁者之刃吸收了部分熵化能量，意外激活武器的「真相追溯」能力；情感具象师带着情感解码器闯入操控者的意识空间，目睹对方竟是被孢子寄生的初代情感守护者。
当三重突破产生共振，光谱星舰启动「文明意识共振计划」，将全宇宙尚存的清醒意识汇聚成金色洪流。觉醒祭坛的碑文突然消散，取而代之的是所有文明共同书写的宣言：「我们选择在矛盾中前行，在怀疑中坚守，因为这正是文明的本质。」金色洪流冲击下，熵化底层协议开始崩解，诺瓦与孢子操控者的身影在光芒中扭曲，他们发出最后的嘶吼：「只要文明存在缺陷，我们终将归来......」
