人类经过十几年的发展除了向太空探讨也同时向着海洋探索地球孕育生命的地方。
军械库总部制定了“虎鲨计划”打算向海洋探索，最新研制的潜艇“海豚001号”进入水下探索着未知的海底，同时军械库也在南极和北极建立了基地。
军械库研制的海豚001号潜水艇具万米的深水下也能自由活动的高性能，配备着超导电性的引擎，能高速运转。
军械库的其他队员们在华夏的北海进行着探索并对海洋的情况记录着详细的数据。
另一边军械库队员们在军械库维修班帮助着维修班的工程师对特工机进行着日常的保养和维修工作并对特空机升级改造，军械库队员们希望特空机不光能在太空和陆地上作战同时也希望特空机在水下也有一定的作战能力。
在宇宙之中飞过一个类似于水母的生物飞到地球躲到北极的海底之中。
从火星卫星轨道中控制人工太阳朝南极方向行进，企图融化南极的冰来淹没人类的文明，计划把地球改造成完全是水的星球。斯休姆从计算机的内存中领会语音数据，模仿南极基地主任和他女儿等人的声音挑衅人类。斯休姆制造了半鱼人士兵迪贡来夺取军械库在南极的海底基地，并制造了怪兽雷丘巴斯和欧布猛斯王作为自己的怪兽兵器。
在水中潜伏的斯休姆操作欧布猛斯王和雷丘巴斯在海底来到了华夏的琼州袭击了在琼州的航天发射基地。
在此之前袭击了，华夏军械库在北极和南极洲的基地。
雷丘巴斯和欧布猛斯王登陆到了琼州岛上，袭击了军械库的航天基地并向着琼州城区进攻。
欧布猛斯王拥有一对骨翼，使他能够以7马赫的速度飞行，欧布猛斯王飞在城市的上空从从上发射焚烧光束他的嘴里发射橙色能量射线将城市给摧毁。
雷丘巴斯通过双眼切换瞬间切换冰封为蓝色，从口中喷射冷冻气体，将大半个城市给冰封住了。
军械库的航空队驾驶胜利飞燕一号战机从空中不断的发射激光导弹攻击着欧布猛斯王和雷丘巴斯，而雷丘巴斯雷丘巴斯双眼发出红光时可从嘴中连续发射火焰弹，火焰弹有着惊人的射程在地面上发准命中大气层外军械库攻击编队的战机令其全军覆没。
战机坠落响起了恐怖的爆炸声和火焰航空队伤亡惨重，军械库作战班的金古桥和乌英达姆在空中飞行来到了琼州城。
中岛洋子驾驶乌英达姆从背部发射出导弹进行远程攻击着欧布猛斯王。
同时，大田结花驾驶军械库金古桥发射佩丹尼姆诱导弹从背部射向雷丘巴斯。
但同时被雷丘巴斯和欧布猛斯王的光盾给轻松的抵挡了。
欧布猛斯王使用破坏大电击从全身释放出蓝色破坏电流光线，将军械库金古桥和乌英达姆给击倒。
刘涛和姚辉在人间体状态下利用瞬间移动金色和青色能量旋涡罩住全身，瞬间来到了琼州城之中。
刘涛和姚辉看到城市之中狼烟西起，硝烟弥漫，迅速使用胜利神光棒和超越之钥变身成特利迦奥特曼复合型与泽塔奥特曼阿尔法甲装型态。
泽塔使用宇宙拳法攻击着欧布猛斯王，而特利迦使用虎鹤双形拳灵活不断的攻击着雷丘巴斯，并配合边腿和后摆腿以及散打的各种腿法灵活的攻击着雷丘巴斯。
雷丘巴斯从嘴中连续发射火焰弹攻击着特利迦奥特曼而特利迦使用奥特护盾从两手作出的用以防御敌人攻击的圆形光之壁抵挡住了雷丘巴斯的火焰弹。
同时切换成奇迹空中型利用高速移动利用奇迹空中型速度和超能力的特点从西面八方打向雷丘巴斯。
另一边，泽塔奥特曼使用贝塔冲击形态使用宇宙拳法攻击着欧布猛斯王。
泽塔奥特曼利用贝塔冲击形态跳跃至六百米的高度并盘旋在上空。
使用贝塔新月斩击从全身聚集光子能量后右手向上、左手向下大幅度伸展后发出的垂首月牙型光刃打向欧布猛斯王。
特利迦奥特曼也使用特利迦切割和手掌光箭灵活不断灵活走位的攻击雷丘巴斯，特利迦切换至奇迹空中型利用高速移动的能力快速飞至泽塔旁边俩奥对视一眼后，特利迦奥特曼切换成至高未来型，并使用光子粉碎机是从头部的能源结晶发射的光之冲击波感与阿古茹本人相同，从特利迦额头上的水晶前将手臂组合成X状，并将积蓄的能源转移到头部，后伸展出右手引导能源扩展后，再首接从头部发射而去将雷丘巴斯给击中浑身产生爆炸，炸成了粉末。
而泽塔切换成德尔塔天爪型态，并手持贝利亚黄昏释放出泽斯蒂姆死亡爆裂起手式与泽斯蒂姆光线相同，但形态与贝利亚奥特曼的帝斯修姆光线相近，且光线由贝利亚黄昏的嘴部发射朝着，内丘巴斯打去。
在海底的水栖生命体斯修姆见到自己的怪兽被消灭后，从大海跳出来，请放下狠话说道：我一定还会再回来的！
斯修姆说完狠话就以以快的速度飞到太空，泽塔正要去追击，此时，特利迦奥特曼拦住了泽塔说道：我去处理，你先回去吧。
说完特利迦奥特曼就切换成奇迹空中型并使用瞬间，移动来到了宇宙之中特利迦奥特曼发现了斯修姆并以极快的速度奇迹光束切割双手放至额头的水晶处后将左左手拳放置肋骨处，然后将右手举过头顶，形成一道蓝色的能量波，然后将光线抛向目标，形成一道蓝色的破坏光线将斯修姆给成功击杀，斯击姆在太空中响起爆炸和火焰。
特利迦奥特曼见状使用，瞬间，移动回到了泽塔身边，二人相视一眼后，飞到天空，在天空画出一道优美的弧线并飞往在军械库队员们的身后，利用逆变身能力回到军械库队员们的身边。
众队员非常高兴，并有说有效的将特空机甲给启动然后军械库队员们就驾驶特空机甲离了琼州城回到了军械库中。
将特空机交给维修班的人，并送到了维修班仓库后就回到了作战班之中。
军械库作战班队员写完作战报告和总结后就去了食堂享受美食，众人吃完晚餐后，回到了宿舍中休息。
军械库作战班队员，洗漱完后，早早的休息了刘涛在单人宿舍房间中点燃一根香烟小吸一口然后吐出烟雾，思考着将如何对抗未来的敌人。
